O P. Baquero nasceu em Manila, Filipinas, no dia 15 de setembro de 1970. Frequentou as escolas primária e secundária com os Salesianos em Pampanga. Em 1989 fez o Noviciado em Bacolod. Pronunciou os Votos perpétuos aos 24 de março de 1998, em Parañaque, sendo ordenado Sacerdote aos 8 de dezembro de 1999, no Santuário Nacional de Nossa Sra. Auxiliadora (sempre em Parañaque, Filipinas).
Depois da Ordenação sacerdotal, desenvolveu a maior parte do seu ministério na linha de frente, na missão salesiana de Papua-Nova Guiné: primeiro em Lariau e Araimiri, de 2000 a 2008, e, depois, na Capital, Port Moresby. De 2014 a 2016 foi Delegado Inspetorial para Papua-Nova Guiné e Ilhas Salomão, sendo em 9 de julho de 2016 nomeado 1º Superior da nova ‘Visitadoria Bv. Filipe Rinaldi’ (PGS).
Como Bispo, o atual Mons. Baquero sucederá a Dom Patrick Taval MSC, falecido em 2013. A Diocese – criada em 1971 e vacante já havia três anos – conta com uma população de 128.300 habitantes (20% dos quais (25.200) são católicos), dez Paróquias, cinco Sacerdotes diocesanos, sete Sacerdotes religiosos e 14 Religiosas.
Atualmente no território da Visitadoria salesiana da PGS existem mais duas Dioceses confiadas a salesianos: a Arquidiocese de Rabaul, a Dom Francesco Panfilo; e a Diocese de Gizo, a Dom Luciano Capelli.
